在大明时期，青藏高原上的藏族及其他少数民族在表面上是接受大明朝廷的统治的。
但是当他们知道大明已经灭亡的消息之后，藏族的那些土司们便开始动起了心思，重新立起了吐蕃国名。
不过，这个新的吐蕃国只存在了两个月，便被秦可仁等人率领四万大军给灭了。
灭亡那些有野心土司容易，完全平定整个青藏高原却并不是那么容易的事情。期间需要头疼的问题是一大堆，废除农奴制度问题，佛教的问题，以至是藏民的保守的问题都成了巨大的阻碍。
再加上青藏高原实在是太大了，而且人口稀少，反叛分子随便找个地方躲起来都很难发觉。
所以萧明乾只得尊重藏族的保守信仰，册封了一大批的活佛，以稳定人心。但是对农奴制度，萧明乾是非常坚定的要废除的。
因为只需存在这样的制度，那么就还会有掌握着大量的资源的土司冒出来反叛。只有将土地等生产资料分配到普通藏民的手中，才能够既得到了普通藏民的支持，又让那些心存叛乱的人没有足够的资源支持他们建立军队。
除了这两个地方之外，战事最为激烈的就属缅甸了。
明末缅甸便数次入侵云南地区，其对中华大地能够说是一直野心不改。
在中华帝国进入云南之前，接到消息的缅甸便出兵云南，先后占据了景洪地区和澜沧地区，以至一度进攻普洱地区。
这个时候，云南的沐王府的沐天波率领大军死死的抵挡在普洱城，使得缅甸一直不能前进一步，直到中华帝国的大军攻到普洱城，缅甸依然野心不死的想要同中华帝国争锋。
但是最终在普洱城南部五十里处的一战，使得进入云南的缅甸军队几乎是全军覆没。
看到中华帝**队如此强大的战斗力，再加上普洱面对缅甸大军的持续进攻已经筋疲力尽了，最终沐天波选择了投降。
当然，对于沐天波，萧明乾还是非常的看重的，再加上他在大明已经灭亡几个月的情况之下，还坚持守护国土，萧明乾给予了他非常优厚的照顾。
虽然没有继续让他做王爷，但是任命他为新占的贵州省的省长，同时在澳洲大陆划出了十万亩的牧场给沐家。