三尸除了寄生虫的尸体解释之外，还被认为是人体邪气所化。
《云笈七签》卷八十一曰:“其三尸者，托阴气以为灵”，又曰:“人死后魂升于天，魄入于地，唯三尸游走，名之曰鬼。”
无论灵或鬼，都是道门中极为常见的名词，其本质也就是天地间异于阴阳之气的邪气。
天地之间，六合之内，其气九州、九窍、五藏、十二节，皆通乎天气。其生五，其气三，数犯此者，则邪气伤人，此寿命之本也。
医学中认为人体之所以得病，便是因为外邪入侵所致，而三尸作为人体邪气，便不难理解为何道教认为人体所得种种疾病皆因三尸而起。
三尸危害人体，道教因此有了种种杀灭三尸的方法，并以斩三尸为得证金丹的基本前提。这些方法主要包括:
一、药物
如何斩灭三尸，道书中提到了众多的药物和药方，常见的包括黄精、丹砂、茯苓、白芷、桃叶(一云桃根)、芜荑等。
《云笈七签》中记载了诸多药方，如:“三月三日取桃叶，一云桃根，捣取汁七升，以大醋一升同煎，令得五六分，先食，顿服之。隔宿无食，即尸虫俱下。”
也有“补诸虚，止寒热，填精髓，下三尸虫”之说。
考其药性，味甘性平，有补中益气，润心肺，填精髓，助筋骨之功。
丹砂味甘性寒，主治身体五脏百病，养精神，安魂益气，轻身，使人精力旺盛，不易衰老，杀精魅邪恶鬼，通血脉，止烦渴，悦泽人面，镇心，主尸疰抽风，解胎毒痘毒，驱邪虐。
茯苓味苦性平，能够安魂养神，调脏气，除肾邪。白芷则味辛性温，可以散风除湿，通窍止痛，散胃、肠、肺三经之邪，而以胃经为主。
桃叶味苦性平，可除尸虫，去疮毒，治恶气。
芜荑味辛性平，主治五脏邪气，散毒化石，杀虫散瘀。
不难看出，这些道教中用来杀三尸的药物，都具有一定杀虫驱邪散瘀的药效，其医学底蕴也正在于此。