到1659年再入长江，郑成功一点成功的机会都没有了。
首先，长江口小小的崇明县城，城内守军不过几千人，郑藩四五万大军，数百门红夷炮都无法快速攻克。
郑成功只能舍弃崇明要点，超南京赶路。
可是焦山门等地，航道狭窄，水流湍急，遍布浅滩礁石漩涡，海船很难通行。
郑藩只能花10天时间将战船一艘艘拉纤过去。
甘辉倒是建议郑成功分出陆军轻装打南京，可这只是一厢情愿，以郑藩的陆上战斗力，脱离船队和重炮太远，对上八旗是凶多吉少。
早在郑成功进长江之时，西南战场先期班师回北京的梅勒额真噶褚哈、玛尔赛一部八旗兵分乘40艘船到了南京。
鞑靼两江总督朗廷佐截下部队，用南京武库的装备和搜罗来的战马将这支野战部队重新武装。
西南战场回来的强兵随后即对郑藩发起几波有力的反冲击，这更减缓了郑成功原本已经很慢的部队展开速度。
随后鞑靼人各地援军陆续开到了，鞑靼人崇明县驻军在16天之内即沿陆路开抵南京，比船快太多了，其余援军同理。
郑藩惨败后，出海时再攻崇明县，这次真打了，依然打不下来，只得撤回厦门舔舐伤口。
在郑藩短暂的江南冒险中，仅在宁波府城周围就屠杀了上万居民，这种海匪作风，人民真欢迎他就见鬼了。
海南给厦门送了一批粮食，拉了郑成功一把，把他救回来，也是避免他继续铤而走险。
郑成功在厦门重整后，目前官兵约为万，战船200多艘，这些兵守厦门问题不大。
郑藩下属5，6000浙江兵大部脱离了郑成功，回到舟山张煌言麾下。
张煌言未参与郑成功的冒险，舟山和广东援军全力投入在沿海战场，自定海炮城南至温州，明军占领6座地势险要的沿海城池，利用郑成功进长江争取到的时间，浙江明军修筑了坚固的工事，鞑靼人要打下来需要付出相当大的代价。
总体看，郑藩南京大败后，明军气势确实受到相当大的打击，但总体布局依然是清晰的，依然可以有所作为，起到一定辅助作用。